2018年7月11日，成都、德阳、绵阳等地普降暴雨，黄许收费站于11日6:00关闭。由于雨势过大，收费站及周边不断积水，进而发生水涝灾害，联网收费系统、计重设备等均遭受损失。期间收费站工作人员搬运防汛沙袋，阻挡洪水漫进收费站房、发电机房，信息中心机电维护人员紧急拆除转移收费岛上机电设备，消除配电房及发电房安全隐患，制作临时夜间照明灯具。

7月12日早晨，雨势减小，洪水褪去，收费广场及车道露出。收费站工作人员做好清淤工作。信息中心机电维护人员则抓紧时间利用备品备件及冗余设备拆装进行抢修，7月12日17:00入口ETC车道、出口ETC车道、出口MTC车道可正常开启。在路管队、计重设备厂家的配合下，入口计重车道于12日21:33修复完毕可正常开启。

至此，黄许收费站水涝抢险完毕，所有收费车道全部恢复正常通行。